More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2101 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  98.95 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  53.11 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  49.7 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  41.86 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  37.36 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.36 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  38.55 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  38.55 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.66 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  38.86 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  38.51 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  37.84 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.04 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  38.86 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.14 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.24 
 
 		 184 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  36 
 
 		 178 aa  94.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.2 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  34.24 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  35.2 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  31.79 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.97 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  40.35 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  37.02 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.72 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.54 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.07 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.22 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.95 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.14 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.2 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  33.15 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  32.46 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.07 
 
 		 222 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  36.36 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  32.61 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  27.37 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  33.52 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  32.58 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.61 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  31.11 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  30.46 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.51 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.21 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.42 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  28.65 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  29.73 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  34.78 
 
 		 421 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  39.77 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.03 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  39.77 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  39.77 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  39.77 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29.78 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  39.77 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  39.77 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  39.77 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  35.84 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  26.99 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  29.55 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  31.28 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  40.36 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.89 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  33.88 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  31.82 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.21 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  31.29 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  31.46 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  31.29 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  32.18 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  30.64 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  29.21 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  32 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  29.21 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  29.95 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  29.55 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  29.21 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  28.74 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1732  cytochrome B561  30.57 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  31.36 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  29.55 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  32.12 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  31.79 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  31.03 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  29.71 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  30.98 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.98 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.66 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  33.33 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  29.83 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  30.06 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  31.22 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  27.53 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  26.44 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  29.38 
 
 		 441 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  28.16 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>