272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1848 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  100 
 
 
193 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.18 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  30 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  30 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  30.34 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.95 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  31.72 
 
 
184 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.48 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.36 
 
 
184 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.87 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.07 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.18 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  33.33 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.85 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  30.85 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.77 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  26.88 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  29.12 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.32 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  26.88 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  30.17 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  30.11 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  27.72 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  28.65 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  27.07 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  29.78 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  31.12 
 
 
410 aa  79  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  26.34 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  30.77 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  27.13 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  29.78 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  30.22 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  27.81 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.78 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  29.12 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  28.43 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  27.22 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  32.02 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  30.57 
 
 
400 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  28.02 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  25.95 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  27.66 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  29.17 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  25.56 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  30.77 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  30.77 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  30.77 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  30.77 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  30.77 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.77 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  30.77 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  31.36 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  30 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  26.7 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  32.14 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  30.3 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  29.28 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  25.65 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  27.87 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  28.98 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  27.66 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  26.23 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  28.89 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  28.73 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  28.41 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  29.05 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  25.41 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  29.57 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  32.12 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  30.46 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.49 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  28.67 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  29.21 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  28.72 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  28.57 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  28.95 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  25.53 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  24.46 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  27.93 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  27.53 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  26.55 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  27.27 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  24.32 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  27.22 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  29.01 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  28.74 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  26.52 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  27.86 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  25.14 
 
 
175 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  25.58 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  26.63 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  30.17 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  27.27 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  26.63 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  27.72 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  30.34 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  29.67 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  28.16 
 
 
191 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  27.09 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  29.84 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>