More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1770 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  36.96 
 
 		 178 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  37.14 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  37.85 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  36.72 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  35.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.26 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  36.16 
 
 		 176 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  35 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  35.96 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  35.96 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  36.96 
 
 		 180 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  35.96 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  36.26 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.44 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.02 
 
 		 175 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.24 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  35.39 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  37.02 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  37.08 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  37.08 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  37.08 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.93 
 
 		 175 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.96 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  37.64 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.13 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  36.63 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  36.11 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.16 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.6 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  43.51 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.39 
 
 		 186 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  36.07 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.83 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.47 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  37.36 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  36.69 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.78 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  33.15 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.36 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  31.28 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.88 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  32.95 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  33.33 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  37.11 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  32.6 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  31.82 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.5 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  32.97 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  36.16 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  36.16 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.2 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  35.23 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  34.62 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  31.61 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  34.62 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.71 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  34.46 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.71 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  31.18 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  38.98 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  44.09 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  33.52 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  30.88 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.88 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.34 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  34.66 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  38.86 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  33.89 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  31.64 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  37.65 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  37.29 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  37.65 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  37.65 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  39.57 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  37.65 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  37.65 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  37.65 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.65 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.91 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3332  cytochrome B561  32.97 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.29 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  37.65 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  32.98 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.78 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  36.26 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  29.32 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  34.81 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  36.5 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  35.36 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  31.41 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  30.53 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  35.56 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.35 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>