More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1568 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  348  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18060  hypothetical protein  90.34 
 
 		 176 aa  295  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.645092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.66 
 
 		 188 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  38.24 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.37 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  37.43 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  37.79 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.79 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.5 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  36.26 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  34.88 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  38.67 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  35.8 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.88 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  35.8 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  35.8 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.88 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.88 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.52 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.84 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  33.33 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  31.84 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  31.84 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  31.84 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.59 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.84 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.84 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  31.84 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  40 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.84 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.52 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.95 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.39 
 
 		 193 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.46 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.09 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.52 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  34.32 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.07 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.71 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.36 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.64 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.56 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.2 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  37.3 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  33.71 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  36.09 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  35.12 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  34.57 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  32.94 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  32.43 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  34.07 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  33.93 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  32.07 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  33.93 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  33.15 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  33.93 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  33.93 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.07 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  32.97 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  36.09 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  30.89 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.99 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  35.58 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  34.44 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3663  cytochrome B561  33.71 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.33 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  34.1 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  31.87 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.87 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  33.92 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.32 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.87 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.87 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.87 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  38.01 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  31.46 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  28.57 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  32.57 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  32.41 
 
 		 416 aa  71.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  33.53 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  31.32 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  31.32 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  31.25 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  31.32 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  35.5 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  35.67 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.37 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  32.37 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  31.82 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  32.37 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.37 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.22 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  29.48 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  32.22 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  32.37 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.91 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>