More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1811 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  93.14 
 
 		 175 aa  332  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  56.29 
 
 		 180 aa  200  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.26 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.05 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.81 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  33.71 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.82 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.11 
 
 		 184 aa  87.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  30.29 
 
 		 204 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  37.43 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  32.75 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  37.43 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  28.16 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  31.79 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  32.75 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.56 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  33.33 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  35.67 
 
 		 180 aa  84  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.11 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  30.99 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  30.99 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  30.99 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  28.24 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.18 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  31.25 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  30.99 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  29.82 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  29.51 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.61 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  31.36 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  29.38 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  34.08 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  32.76 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.85 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.68 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  27.49 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  28.57 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  29.41 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  32.3 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  31.98 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  29.31 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  30.95 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  29.94 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.76 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  29.55 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  27.49 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  30.46 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  27.49 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.33 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.68 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  27.49 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  27.49 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.57 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  30.29 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  30.36 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  28.66 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  31.03 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.13 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  29.48 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  28.49 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  29.07 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  28.74 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  29.07 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  29.07 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  28.42 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  29.48 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  33.91 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  31.58 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.65 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  27.68 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.71 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  27.68 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  30.81 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.1 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.68 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  30.73 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  35.29 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  27.68 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.68 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  30.73 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  27.68 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.61 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  27.68 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  30.22 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  31.48 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.49 
 
 		 195 aa  72  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  31.03 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>