More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3290 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  98.88 
 
 		 178 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  91.01 
 
 		 178 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  91.01 
 
 		 178 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  91.01 
 
 		 178 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  82.58 
 
 		 178 aa  309  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  89.33 
 
 		 178 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  67.23 
 
 		 229 aa  245  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  65.91 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  65.91 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  65.91 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  65.91 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  65.91 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  65.34 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  58.82 
 
 		 190 aa  207  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  60.95 
 
 		 176 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  47.65 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  41.86 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  40.88 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  40.88 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  39.77 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  40.44 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  40.8 
 
 		 186 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  36.16 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  36.16 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  36.16 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  42.37 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  40.35 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  41.24 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  38.64 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  40.23 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  40 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  36.93 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  36.93 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  36.93 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.93 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.93 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  36.93 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.93 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.93 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.78 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  36 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  42.04 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  42.04 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  36 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  40.91 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  42.04 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  35.43 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  40.91 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  37.21 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  40.91 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.91 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  35.43 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  35.43 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  41.4 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  35.43 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  40.76 
 
 		 176 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  38.55 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  40.46 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  36.87 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  40 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  40 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  38.29 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  37.29 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  35.47 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  31.28 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  37.93 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  35.91 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.52 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  34.83 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32.6 
 
 		 184 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.66 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  36.93 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.33 
 
 		 180 aa  84.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  36 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  36.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  34.09 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  30.73 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  36.16 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  35.59 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  33.15 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  33.87 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.33 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  34.41 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  29.94 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  32.58 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.83 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  30.99 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.31 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  36.57 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  34.52 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  37.36 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  31.95 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  31.11 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.11 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  31.07 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  31.28 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  31.69 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>