More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0005 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  100 
 
 
177 aa  345  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  90.96 
 
 
177 aa  321  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  91.48 
 
 
176 aa  320  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  91.48 
 
 
176 aa  320  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  90.34 
 
 
176 aa  317  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  90.91 
 
 
176 aa  316  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  90.34 
 
 
176 aa  315  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  81.92 
 
 
175 aa  275  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  80.79 
 
 
175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  80.92 
 
 
174 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  80.79 
 
 
175 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  61.85 
 
 
177 aa  189  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  56.9 
 
 
179 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  58.05 
 
 
178 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  54.86 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  58.86 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  56.89 
 
 
188 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  56.89 
 
 
188 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  58.08 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  60.12 
 
 
188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  57.95 
 
 
188 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  58.9 
 
 
177 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  57.67 
 
 
177 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  58.05 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  51.7 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  57.67 
 
 
177 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  58.9 
 
 
177 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  51.15 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  48.28 
 
 
177 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  50.3 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  54.34 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  52.02 
 
 
174 aa  121  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  38.51 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.42 
 
 
184 aa  104  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  37.79 
 
 
174 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.02 
 
 
185 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  37.91 
 
 
180 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  40.46 
 
 
180 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  38.73 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  34.71 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.62 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  40.11 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  35.23 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.97 
 
 
186 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.97 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.97 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  37.99 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.84 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.94 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.84 
 
 
182 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.78 
 
 
191 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.87 
 
 
197 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.15 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.26 
 
 
184 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.7 
 
 
199 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  87.8  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  32.91 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32.56 
 
 
186 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  34.81 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  37.78 
 
 
182 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  32.58 
 
 
186 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.18 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.6 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  38.1 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  35.98 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.84 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.5 
 
 
183 aa  84.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  32.57 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.29 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  30.86 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.84 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  32.16 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.03 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.27 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  32.97 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.35 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.76 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  31.58 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.66 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  31.58 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  31.58 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.09 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  30.99 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  37.85 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  32.94 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  37.58 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.98 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  28.49 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  37.95 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.59 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  33.54 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.38 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  36.63 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  30.11 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.73 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  35.76 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  32.53 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>