More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0508 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  56.8 
 
 		 190 aa  161  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  42.68 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  40.24 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  43.18 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.78 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  39.26 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  38.51 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.51 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  39.08 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  38.51 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  38.98 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  38.29 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  39.11 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.87 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  36.36 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.16 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.62 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.62 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.39 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  37.21 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.5 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.95 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.62 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  38.6 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  37.43 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.95 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.42 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.62 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.8 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.64 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.64 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.42 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.68 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.68 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  34.76 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  37.36 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  34.91 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.71 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  37.21 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  37.36 
 
 		 176 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  37.21 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.8 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  34.27 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  34.27 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  35.87 
 
 		 406 aa  95.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  34.27 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  36.78 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  36.46 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32.78 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  39.23 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.71 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  36.78 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.71 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  33.71 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.71 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.71 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  35.88 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  36.09 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.86 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  36.78 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.91 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  36.78 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  36.93 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  36.09 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  36.16 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  36.78 
 
 		 177 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  36.78 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.02 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  34.94 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.68 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  40.46 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  37.57 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.91 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  33.33 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  33.71 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  26.82 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  36.16 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  37.02 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  37.02 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.5 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  34.46 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  37.02 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  32.39 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  31.35 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.33 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.88 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  34.29 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  37.04 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  32.78 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.33 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  32.09 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  32.09 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  32.09 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.46 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  32.57 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  31.41 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  34.91 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>