More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01688 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  78.38 
 
 		 190 aa  276  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  65.24 
 
 		 188 aa  231  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  64.71 
 
 		 188 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  40.12 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  40.12 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  38.37 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  39.11 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  40.7 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  37.97 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  37.58 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  36.97 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.63 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  38.29 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  38.29 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  36.21 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  38.29 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  36.42 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.57 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  37.43 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  39.2 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  34.64 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  37.57 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  37.78 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.73 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  37.64 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  34.66 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  38.98 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  36.56 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.12 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.84 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  36.02 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  37.23 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.75 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.6 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.39 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  36.41 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  38.37 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  38.12 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  40.22 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  37.71 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  34.48 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  40.22 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  38.12 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  34.46 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  36.22 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  35.09 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.8 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  36.61 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  29.82 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.92 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.9 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.3 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  36.51 
 
 		 400 aa  95.9  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  32.51 
 
 		 410 aa  95.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  35.43 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  37.93 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.33 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  37.99 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  36.09 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  34.97 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  35.14 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  34.97 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  35.59 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  34.1 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.07 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  34.24 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  38.89 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  39.64 
 
 		 172 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  30.06 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  36.31 
 
 		 177 aa  91.3  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.1 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  32.58 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.09 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  38.04 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  33.85 
 
 		 406 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  32.75 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.92 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  36.76 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  32.95 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  36.67 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.91 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.1 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.1 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  36.96 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  37.63 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  34.68 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  35.11 
 
 		 420 aa  88.6  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  36.46 
 
 		 190 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  31.82 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  35.91 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  37.43 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>