More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2358 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  347  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  81.14 
 
 		 180 aa  288  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  40.34 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  39.08 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.8 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  42.86 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  39.08 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  38.01 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  38.51 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  40.46 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  40.24 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  38.51 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  38.29 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  38.51 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.66 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.57 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.73 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  37.43 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.6 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.88 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  37.57 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  37.65 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.99 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.44 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  37.78 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  35.96 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  38.6 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  35.06 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.84 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.26 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.21 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.93 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  38.73 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  37.5 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.41 
 
 		 201 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.21 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30.68 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.52 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  34.07 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  34.66 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  34.66 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  34.66 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  38.15 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  37.57 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.68 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.12 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  37.08 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.71 
 
 		 203 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  35.75 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  35 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  36.05 
 
 		 176 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.46 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.35 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  31.35 
 
 		 222 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  36.78 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  36.46 
 
 		 400 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  36.05 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  37.57 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  36.93 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  34.66 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  38.01 
 
 		 206 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  35.26 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  39.66 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.26 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  35.84 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  35.47 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  33.53 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  39.66 
 
 		 177 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  35.47 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  35.47 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.91 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.26 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  34.29 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  34.68 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  38.64 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  35.82 
 
 		 410 aa  89  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  35.8 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  26.59 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  36.42 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  34.23 
 
 		 416 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  32.98 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  33.89 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  32.61 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  37.43 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.14 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.14 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  39.29 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  39.66 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.57 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.57 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.57 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.57 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.57 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.53 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.71 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.1 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  32.95 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  40.88 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>