More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0252 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  81.14 
 
 
178 aa  288  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  42.68 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.08 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  40.12 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.43 
 
 
182 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.08 
 
 
182 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.08 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  39.77 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  39.08 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  40.57 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  38.6 
 
 
193 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  36.67 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  38.51 
 
 
186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  39.08 
 
 
186 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  37.79 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.46 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.42 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  42.61 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  38.51 
 
 
186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  38.51 
 
 
186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  38.51 
 
 
186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.08 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  39.11 
 
 
189 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.35 
 
 
186 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  39.18 
 
 
186 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  40.12 
 
 
178 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.96 
 
 
201 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  38.64 
 
 
189 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  40.46 
 
 
177 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  35.8 
 
 
180 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  40.23 
 
 
188 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  36.21 
 
 
191 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  41.14 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  37.57 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.36 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.81 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.09 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  37.19 
 
 
410 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  38.95 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.59 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  33.15 
 
 
222 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.08 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  38.37 
 
 
177 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  38.89 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  38.29 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  37.7 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.14 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  38.37 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  38.95 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  38.37 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  35.06 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  36.21 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.84 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  36.36 
 
 
190 aa  94.4  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  39.18 
 
 
206 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.63 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.32 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.86 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  35.39 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  36.11 
 
 
179 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.57 
 
 
173 aa  92  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  37.14 
 
 
175 aa  92  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.63 
 
 
175 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  35.09 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  35.67 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  35.96 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  35.29 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  33.52 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  39.88 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  33.52 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  37.57 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.48 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  33.52 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  36.63 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  37.7 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  37.7 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.48 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  35.57 
 
 
416 aa  89  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  35.2 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  38.2 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  33.14 
 
 
204 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  35.2 
 
 
189 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  34.04 
 
 
192 aa  87.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  36.78 
 
 
179 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  36.16 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  36.93 
 
 
209 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  35.59 
 
 
182 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  35.47 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  34.66 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  38.1 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  33.52 
 
 
400 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.26 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  34.68 
 
 
176 aa  85.1  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  35.56 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.96 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  33.33 
 
 
175 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.22 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  36.87 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.78 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>