More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1941 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  61.41 
 
 		 195 aa  217  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  58.6 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  51.11 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  38.07 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.68 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  36.16 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  43.93 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.56 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.41 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.84 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.43 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  36.63 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  35.91 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  39.34 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  36.76 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.3 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  33.53 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  38.8 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.8 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  34.27 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  34.13 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.27 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  31.76 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.67 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  33.71 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  34.81 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.94 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  36.41 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  38.25 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.54 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  32 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  34.81 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  35.91 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  36.46 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  33.7 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  31.25 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  28.65 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.52 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.7 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.82 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  30.94 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  32.97 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  32.97 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  32.97 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  28.09 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  33.88 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  31.82 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  35.98 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  35.96 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  35.96 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  35.87 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  38.01 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.43 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.43 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.43 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.43 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.43 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  32.98 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.86 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  31.84 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  35.36 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  31.67 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  31.67 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  30.48 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  29.38 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  37.3 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.29 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  33.33 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.15 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  37.04 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.97 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  33.95 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  31.52 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  29.89 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  32.42 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  29.89 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.18 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  32.42 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  29.89 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  32.22 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  32.42 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  29.21 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  30.86 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.93 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  36.99 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  29.55 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  31.82 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  31.28 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  31.84 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  36.69 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  30.98 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  31.28 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.4 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  33.15 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>