More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2093 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  100 
 
 
175 aa  350  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  93.14 
 
 
175 aa  332  2e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  56.29 
 
 
180 aa  204  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.88 
 
 
182 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  35.47 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.05 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.4 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  30.86 
 
 
204 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.95 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.58 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  33.92 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  33.92 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.67 
 
 
184 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.98 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.67 
 
 
184 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  28.16 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  36.26 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  32.16 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  36.26 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  31.58 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  31.58 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  31.58 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  31.79 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  31.48 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  27.06 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  32.77 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  34.34 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  28.65 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  28.89 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.74 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  29.82 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  28.65 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  30.54 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  31.03 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  29.89 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  27.49 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  30.17 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  29.41 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  33.91 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  29.01 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  30.46 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  29.61 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.95 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.32 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  31.32 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.32 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  31.43 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  27.78 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  30.06 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  28.33 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  33.33 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  30.23 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  28.66 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  30.77 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  30.06 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  28.81 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  30.06 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.56 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.18 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  30.11 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.32 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  28.74 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  28.74 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  28.74 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  28.81 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  28.81 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.81 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.81 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  28.81 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  28.07 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  28.07 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  28.07 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  28.16 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  34.48 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  28.81 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  32.16 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  29.34 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.32 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  29.21 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  30.95 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  30.17 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  30.86 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  28.32 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  30.23 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  28.41 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  29.45 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  27.68 
 
 
229 aa  72  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  31.61 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.11 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.9 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.79 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  28.83 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.11 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  29.88 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.03 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>