More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2322 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  58.56 
 
 		 190 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  58.1 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  58.1 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  52.13 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5252  cytochrome B561  58.11 
 
 		 156 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  44.15 
 
 		 441 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  44.44 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  38.97 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  42.08 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  40.54 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.54 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  40.76 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  40.54 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  40.76 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  40.76 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  41.53 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  40.76 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  41.08 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  40.98 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  40.88 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  40.54 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  42.31 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  39.89 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  42.13 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.7 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  41.44 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  40.23 
 
 		 416 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  40.31 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  41.21 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  40.33 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  39.46 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.3 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  39.11 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  38.38 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.78 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.57 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  41.44 
 
 		 420 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  36.96 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  39.56 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  43.17 
 
 		 186 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.96 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.64 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  37.91 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  37.16 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  40.21 
 
 		 421 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  36.31 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.55 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  36.46 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  41.18 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  36.26 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  35 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  39.41 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  41.53 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  42.78 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  42.08 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  37.7 
 
 		 180 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  37.78 
 
 		 179 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.71 
 
 		 175 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.71 
 
 		 175 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  34.83 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.71 
 
 		 178 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  35.56 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.41 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  37.43 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.81 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.09 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  38.42 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  35.57 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0144  cytochrome B561  36.27 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.876682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.7 
 
 		 175 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  35.2 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.07 
 
 		 173 aa  91.3  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  35.45 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35.16 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.61 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  37.85 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  37.85 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  36.61 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  35.64 
 
 		 406 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.02 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  34.07 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  34.62 
 
 		 184 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  31.61 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  34.07 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  34.07 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  35.68 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.62 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  39.89 
 
 		 183 aa  87.8  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.02 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.02 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  40.88 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.02 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.02 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  34.02 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.12 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  34.02 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  34.02 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  34.02 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>