More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0471 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  100 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  68.54 
 
 		 189 aa  244  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  60.89 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  66.48 
 
 		 186 aa  207  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  62.22 
 
 		 188 aa  201  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  56.12 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  65.32 
 
 		 172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  55.8 
 
 		 178 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  47.59 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  44.09 
 
 		 184 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  49.72 
 
 		 174 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  43.5 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  43.33 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  43.5 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  43.5 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  45.05 
 
 		 186 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  43.09 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  44.51 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  44.44 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  43.09 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  43.89 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  42.7 
 
 		 182 aa  147  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  44.44 
 
 		 195 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  44.89 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  50.57 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  42.54 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  42.78 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  44.74 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  43.75 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  45.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  45.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  45.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  45.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  45.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  45.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  42.47 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  45.36 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  41.04 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  40.21 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  41.21 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  40.46 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  45.93 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  41.34 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  41.24 
 
 		 182 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.68 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.61 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.83 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  38.42 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.61 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.12 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  37.71 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  41.75 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  44.09 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  41.95 
 
 		 178 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.45 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  43.09 
 
 		 183 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.45 
 
 		 175 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  40.91 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.42 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  39.89 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  36 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  36.9 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.85 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  37.85 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.99 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  34.76 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  37.97 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  37.76 
 
 		 441 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.03 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  39.05 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  38.73 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  37.71 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.16 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  38.54 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  39.05 
 
 		 176 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  38.07 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  33.71 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  37.02 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  38.46 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  39.78 
 
 		 177 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  33.52 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  37.36 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.36 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  36.11 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.39 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  40.11 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  32.97 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.09 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  36 
 
 		 190 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.71 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  32.97 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  39.78 
 
 		 177 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36.57 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  36.57 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  34.81 
 
 		 178 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  37.87 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  36.81 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  37.87 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  38.46 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>