More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1029 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  100 
 
 		 181 aa  357  5e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  63.53 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  58.33 
 
 		 174 aa  187  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  53.98 
 
 		 189 aa  180  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  55.88 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  55.87 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  51.18 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  50.88 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  50.88 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  46.59 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  50.88 
 
 		 186 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  50.88 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  52.07 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  51.18 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  48.52 
 
 		 193 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  50.29 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  50.29 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  47.34 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  49.71 
 
 		 186 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  49.72 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  47.34 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  49.7 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  49.12 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  46.41 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  52.3 
 
 		 209 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  50.3 
 
 		 206 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  50.3 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  45.4 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  43.41 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  44.94 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  50.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  50.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  50.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  50.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  50.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  50.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  50.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  44.12 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  43.79 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  43.93 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  44.07 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.15 
 
 		 188 aa  120  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  48.81 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  43.09 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  44.83 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  41.11 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  39.43 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  50.3 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  38.12 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  46.02 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  37.99 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  37.14 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.93 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  39.43 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  39.53 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  38.15 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  37.93 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.99 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  38.95 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.36 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  39.66 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  36.78 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  38.86 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  33.7 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.7 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  40 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  37.57 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  36.46 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  39.08 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  36.57 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  36.36 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  35.26 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  36.59 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.01 
 
 		 201 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  37.08 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  39.11 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  37.14 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  34.48 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  41.99 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  35.39 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  38.55 
 
 		 420 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  38.51 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  37.85 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  38.25 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  38.51 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  37.1 
 
 		 441 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  37.5 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  37.64 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  37.5 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  38.51 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  36.72 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  36.21 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  38.42 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  34.83 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  36 
 
 		 189 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.85 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  40.66 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  39.56 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  30.18 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>