More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1271 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  100 
 
 
187 aa  367  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  80.21 
 
 
186 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  80.21 
 
 
186 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  80.75 
 
 
186 aa  295  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  79.68 
 
 
186 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  98.28 
 
 
187 aa  293  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  98.28 
 
 
187 aa  293  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  98.28 
 
 
187 aa  293  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  98.28 
 
 
187 aa  293  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  98.28 
 
 
187 aa  293  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  98.28 
 
 
187 aa  293  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  98.28 
 
 
187 aa  293  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  78.61 
 
 
186 aa  290  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  77.54 
 
 
186 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  75.96 
 
 
186 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  77.54 
 
 
186 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  74.86 
 
 
186 aa  283  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  77.01 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  67.76 
 
 
184 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  65.61 
 
 
189 aa  258  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  65.03 
 
 
184 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  63.54 
 
 
183 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  55.68 
 
 
195 aa  187  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  53.85 
 
 
193 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  54.55 
 
 
193 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  54.02 
 
 
197 aa  184  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  48.91 
 
 
189 aa  178  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  51.41 
 
 
185 aa  176  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  57.98 
 
 
188 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  51.09 
 
 
188 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  51.46 
 
 
178 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  44.57 
 
 
197 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  48.57 
 
 
186 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  45.56 
 
 
182 aa  154  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  47.67 
 
 
174 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  44.33 
 
 
222 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  44.27 
 
 
199 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  48.55 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  44.69 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.67 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  46.59 
 
 
209 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  47.7 
 
 
181 aa  124  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  41.38 
 
 
184 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  38.79 
 
 
191 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  42.35 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  45.45 
 
 
201 aa  118  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  40.11 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.22 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  43.39 
 
 
197 aa  111  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.98 
 
 
203 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  43.26 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  34.09 
 
 
183 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  35.96 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  34.71 
 
 
180 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  39.76 
 
 
188 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  38.86 
 
 
441 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  40 
 
 
187 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  44.32 
 
 
193 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  36.49 
 
 
416 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  38.55 
 
 
181 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.22 
 
 
187 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  39.16 
 
 
188 aa  104  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  37.3 
 
 
191 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.5 
 
 
190 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  38.6 
 
 
196 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  34.68 
 
 
176 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  33.53 
 
 
176 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  35.39 
 
 
183 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  36.05 
 
 
191 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.29 
 
 
183 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  35.23 
 
 
176 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.29 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.11 
 
 
182 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  36.09 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.11 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  37.97 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.37 
 
 
183 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.89 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  37.28 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  37.43 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  36.84 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  36.26 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  36.84 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.12 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.12 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  37.22 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  36.61 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.35 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  31.35 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  33.53 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.57 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  36.05 
 
 
178 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.48 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  36.93 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  35.29 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.91 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  40.36 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  35.29 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  35.2 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  33.72 
 
 
191 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>