More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2955 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  82.86 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  65.24 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  65.78 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  65.14 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  59.68 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  59.57 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  56.91 
 
 		 186 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  56.91 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  56.91 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  56.91 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  56.91 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  56.83 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  59.22 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  58.66 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  55.87 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  57.3 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  59.2 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  60.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  60.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  60.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  60.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  60.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  60.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  60.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  59.54 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  50.57 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  50.56 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  49.17 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  47.13 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  43.98 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  43.01 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  45.65 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  40.83 
 
 		 182 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  43.27 
 
 		 174 aa  134  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  48.54 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  43.1 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  42.22 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.47 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.6 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.58 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  38.55 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.96 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  37.57 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  37.57 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.29 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.12 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.36 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.63 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.43 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  39.2 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.57 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  39.23 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  36.7 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  36.7 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  33.14 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.57 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  36.69 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  36.21 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.06 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  34.05 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  39.39 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  39.19 
 
 		 416 aa  98.6  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  39.01 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.09 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  35.42 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  33.7 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  40.11 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  35.88 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  41.34 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  37.5 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  32.93 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  34.12 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.99 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  32.94 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.48 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  32.2 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  35.09 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  32.95 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  31.32 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  33.7 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3000  cytochrome B561  37.85 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426718  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  36.72 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.94 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.32 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  36.36 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  29.45 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  32.74 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  35.76 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  37.14 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  34.91 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  30.86 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  36.09 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  31.58 
 
 		 410 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  34.71 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30.86 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  38.29 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  33.73 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>