More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7458 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  43.79 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  44.85 
 
 
184 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  43.2 
 
 
186 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  43.2 
 
 
186 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  43.2 
 
 
186 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  43.03 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  41.71 
 
 
186 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  41.18 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  40.35 
 
 
186 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  39.2 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  40.83 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  39.43 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  40.35 
 
 
186 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  38.24 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  39.41 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  37.93 
 
 
193 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  38.24 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  40 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  37.36 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  39.05 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  41.62 
 
 
186 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  38.46 
 
 
178 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.9 
 
 
197 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  36.11 
 
 
199 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  37.5 
 
 
183 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.56 
 
 
222 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  38.15 
 
 
185 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  31.29 
 
 
183 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  39.88 
 
 
172 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.36 
 
 
191 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  42.01 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  42.01 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  42.01 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  42.01 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  42.01 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  42.01 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  42.01 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.5 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.76 
 
 
187 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.5 
 
 
182 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  39.88 
 
 
178 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  41.92 
 
 
187 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  34.95 
 
 
188 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.94 
 
 
186 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  33.53 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  37.28 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.71 
 
 
179 aa  94.7  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.37 
 
 
181 aa  94.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.4 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  39.41 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.15 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  34.43 
 
 
188 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.42 
 
 
190 aa  92.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.5 
 
 
174 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  32.62 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  35.23 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.71 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  31.67 
 
 
181 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  34.46 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.24 
 
 
182 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.24 
 
 
182 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.15 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  30.59 
 
 
184 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.07 
 
 
180 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  34.76 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  31.18 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29.59 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  34.68 
 
 
177 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  35.33 
 
 
178 aa  85.1  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  32.75 
 
 
188 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  32.75 
 
 
188 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.75 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.75 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  32.75 
 
 
188 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.75 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.75 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  34.78 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.75 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  32.94 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.38 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  32.95 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.76 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  29.94 
 
 
177 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.33 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  33.33 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  28.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.56 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  36.47 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  34.57 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  31.95 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  33.72 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  33.14 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  36.02 
 
 
182 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  28.99 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  35.33 
 
 
416 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  33.71 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  28.99 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  34.57 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>