289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02672 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4003  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.2 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288533  normal  0.223807 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  38.38 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  35.33 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.07 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  34.69 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.04 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  36.36 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  34.18 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.51 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.96 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  33.51 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  33.51 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  34.22 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  33.16 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  32.98 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  35.23 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  34.22 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  34.22 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  34.04 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  32.45 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  34.22 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  33.33 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  36.02 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  32.28 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  32.8 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  32.8 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  32.28 
 
 		 183 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.21 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.94 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  32.26 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  32.79 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  31.72 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.68 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.94 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  35.71 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  32.62 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.94 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  31.96 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  34.22 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.4 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  34.88 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  34.39 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.62 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  34.59 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  31.96 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  32.26 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  31.96 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  31.96 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.28 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  31.44 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  31.55 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  29.95 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  32.63 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.6 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  31.69 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  31.11 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  30.54 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  33.86 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  29.89 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.16 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  31.41 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  33.85 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  31.61 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2822  cytochrome B561  34.04 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.57 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  28.42 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.17 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.96 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  29.03 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  28.86 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  28.33 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.26 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  28.33 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.98 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.44 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  27.51 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  28.49 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  28.33 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  28.33 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  30.98 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  28.33 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  28.95 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  29.44 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  27.78 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  27.66 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  28.18 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  27.66 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>