More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3478 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  100 
 
 		 180 aa  356  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  45.35 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  40.45 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  40.45 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  42.35 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.79 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  41.67 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  40.94 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  38.24 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  46.76 
 
 		 416 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.64 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  37.06 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.88 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.71 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.71 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.71 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.53 
 
 		 186 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.64 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.63 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  40.83 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  40 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.12 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.56 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  35.84 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.8 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  37.91 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.29 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.05 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.12 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  36.93 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  38.69 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  36.84 
 
 		 197 aa  98.2  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  36.36 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.24 
 
 		 175 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  38.01 
 
 		 176 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.12 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  38.01 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.93 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.42 
 
 		 189 aa  97.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.1 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  38.1 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  39.08 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  34.12 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  34.07 
 
 		 180 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  35.8 
 
 		 177 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  35.88 
 
 		 188 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  35.88 
 
 		 188 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  35.88 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  36.93 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.12 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  36.97 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.5 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  36.97 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  36.97 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  33.33 
 
 		 182 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  38.12 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.28 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  38.69 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.63 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  40.91 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  38.46 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.48 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  34.83 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  32.24 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  34.48 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  39.08 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  37.43 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  35.88 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  32.94 
 
 		 206 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.2 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  27.68 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  40.34 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  40.15 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  36.31 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  33.71 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  38.29 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  37.57 
 
 		 441 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  40.31 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  35.23 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  30.54 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  37.79 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.76 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.04 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  32.76 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  35.29 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  35.29 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  35.29 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  35.29 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.29 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  35.29 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  27.07 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  35.29 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  35.96 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  34.48 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.87 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.99 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>