More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1404 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  100 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  43.26 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  42.13 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  41.57 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  43.5 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  41.57 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  40.45 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  42.94 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  41.57 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  41.57 
 
 		 183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  41.01 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  42.13 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  42.44 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  44.07 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  45.76 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  40.45 
 
 		 183 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  41.9 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  41.86 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  41.86 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  40.45 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  41.86 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  41.86 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  41.86 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  41.86 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  41.86 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  41.86 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  41.86 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  43.58 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  39.89 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  41.04 
 
 		 213 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  39.89 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  45.76 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  38.89 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  42.7 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  42.13 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  42.7 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  38.76 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  38.42 
 
 		 183 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  39.33 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  37.85 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  42.13 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  37.7 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  37.29 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  39.33 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  41.01 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  40.45 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  38.2 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  36.87 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  44.07 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  36.87 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  41.34 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  36.31 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  40.94 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  39.33 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1042  cytochrome B561  41.52 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  40.94 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  40.94 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  40.94 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  40.34 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  41.14 
 
 		 186 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  40.11 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  42.53 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.57 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  39.55 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  38.29 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  39.33 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  39.33 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  40.46 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.95 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  41.76 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2822  cytochrome B561  37.85 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  39.41 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.99 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  40.8 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  38.04 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.41 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  39.43 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  38.04 
 
 		 193 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.67 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0949  cytochrome b561  40.45 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000303039  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  34.5 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.67 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  29.48 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  38.95 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  39.11 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  38.69 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  39.77 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  38.29 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  39.08 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  35.03 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  37.57 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  31.82 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  37.87 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  40.12 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.86 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  38.64 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  35.5 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  36.05 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>