More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1316 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  75.96 
 
 		 183 aa  283  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  67.6 
 
 		 183 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  66.48 
 
 		 183 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  67.04 
 
 		 183 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  67.04 
 
 		 183 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  65.36 
 
 		 183 aa  253  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  67.6 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  67.04 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  67.04 
 
 		 183 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  65.36 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  65.73 
 
 		 198 aa  222  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  62.92 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  55.19 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  50 
 
 		 183 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  52.57 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  52.57 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1042  cytochrome B561  58.48 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  45.2 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  50.57 
 
 		 182 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  52.57 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  50.85 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  51.41 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  50 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  48.86 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  51.41 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  51.41 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  50.85 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  51.12 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  48.59 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  48.59 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  48.59 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  48.59 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  48.59 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  48.59 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  48.59 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  50 
 
 		 183 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  48.59 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  44.94 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  45.05 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  46.63 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  43.82 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  46.89 
 
 		 213 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  48.5 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  48.02 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  49.15 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  44.94 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  44.94 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  44.94 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  46.15 
 
 		 190 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  45.6 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  45.6 
 
 		 192 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  45.05 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  44.32 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  44.32 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2822  cytochrome B561  44.94 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0949  cytochrome b561  44.26 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000303039  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  39.33 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.26 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  27.68 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  28.25 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  29.14 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  33.7 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.7 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.37 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  31.52 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  31.15 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  34.46 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  34.07 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  29.63 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  35.8 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  30.69 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  31.46 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.43 
 
 		 222 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  28.57 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  30.69 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  27.07 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.03 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  35.98 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.21 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  32.04 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  28.25 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  28.25 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  28.25 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4003  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.41 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288533  normal  0.223807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  28.25 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.35 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  30.51 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  27.37 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  33.72 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  28.16 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  28.16 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  30.43 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.98 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  28.8 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  28.18 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  27.53 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>