More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2152 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  56.29 
 
 		 175 aa  204  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  56.29 
 
 		 175 aa  200  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.33 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  43.08 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  32.97 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.2 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  38.1 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.33 
 
 		 213 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  35.8 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  37.2 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  28.74 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  36.99 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36.99 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.47 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  40.77 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.73 
 
 		 191 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.57 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  36.05 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.95 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  31.61 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  33.95 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  37.65 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  33.95 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  31.41 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  38.46 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  36.72 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  40 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  36.72 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  36.72 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  34.57 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.51 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  33.95 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30.68 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.05 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  30 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  29.55 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  30 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  29.55 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  33.13 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  29.55 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  34.83 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.95 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.59 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30.11 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  34.88 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  40 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  33.54 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  31.36 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  34.35 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.11 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  40 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  40 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.14 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  29.31 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.35 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  31.52 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  33.53 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.72 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  31.74 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  30.54 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  32.58 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  32.94 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  31.93 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  29.45 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  34.62 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.29 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  39.23 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  39.23 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  32.1 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.94 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  35.42 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  32.47 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  37.01 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  31.87 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  32.37 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.54 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  30.61 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.94 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  29.94 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  29.94 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.1 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  31.71 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  32.32 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  30.36 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  30.1 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.29 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  38.81 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  32.95 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.85 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.33 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>