More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0199 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  100 
 
 		 174 aa  341  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  77.59 
 
 		 174 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  77.01 
 
 		 174 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  60.12 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  42.01 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  42.94 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  39.39 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  40.94 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  40.35 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  36.26 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.26 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.26 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  36.26 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  36.26 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.88 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  33.72 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  36.26 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  33.92 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  31.68 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  35.67 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  37.29 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  36.81 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  40.35 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  39.66 
 
 		 190 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  39.77 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  39.77 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  39.77 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.72 
 
 		 183 aa  97.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  38.24 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  40.34 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  34.12 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  40.12 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  30.99 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  38.27 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.74 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  33.95 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  33.72 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  30.59 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  30.59 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  30.59 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  41.24 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  37.57 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  33.78 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.59 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  30.59 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.59 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.59 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.59 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.56 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  33.54 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  31.98 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  34.76 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  28.41 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  31.98 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  31.98 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  37.58 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  34.12 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  33.53 
 
 		 204 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  36.97 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  30.59 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  30.59 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  36.36 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  38.51 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  30.59 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  31.71 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  30.59 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.37 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  35.53 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  30.59 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  33.92 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.3 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  35.53 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  34.87 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  34.87 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  33.52 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  34.87 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  32.94 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  33.92 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  35.12 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  29.41 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  36.63 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.09 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  31.95 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  29.41 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.3 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  34.66 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  33.73 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.75 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.29 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.4 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  32.73 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.39 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.37 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.79 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  30.23 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32.16 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  35.26 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  32.56 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>