More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0636 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  90.09 
 
 
225 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  94.38 
 
 
178 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  94.38 
 
 
178 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  94.38 
 
 
178 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  94.38 
 
 
178 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  94.38 
 
 
178 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  70.62 
 
 
178 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  68.93 
 
 
178 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  68.93 
 
 
178 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  68.93 
 
 
178 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  69.49 
 
 
178 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  68.36 
 
 
178 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  67.23 
 
 
178 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  60.95 
 
 
190 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  62.35 
 
 
176 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  49.41 
 
 
191 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  43.27 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  40.12 
 
 
180 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  40.46 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  42.44 
 
 
182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  39.88 
 
 
183 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  41.86 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  39.31 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  37.78 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  35.67 
 
 
176 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  35.67 
 
 
176 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  35.67 
 
 
176 aa  111  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  35.67 
 
 
176 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.67 
 
 
176 aa  111  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.67 
 
 
176 aa  111  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.67 
 
 
176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.47 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  35.09 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  35.09 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  35.09 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  38.73 
 
 
180 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  41.76 
 
 
183 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  40 
 
 
181 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  40 
 
 
181 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  40 
 
 
181 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  35.47 
 
 
177 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  36.36 
 
 
179 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  40.25 
 
 
176 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  40.25 
 
 
176 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  40.25 
 
 
176 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  39.62 
 
 
176 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  40.24 
 
 
181 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  36.26 
 
 
192 aa  99.4  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  38.99 
 
 
176 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  35.67 
 
 
174 aa  98.2  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  36.05 
 
 
184 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  41.14 
 
 
178 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  36.72 
 
 
176 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  37.65 
 
 
181 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  37.85 
 
 
179 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  32.75 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.5 
 
 
182 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  35.36 
 
 
183 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  31.4 
 
 
178 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  37.06 
 
 
195 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  37.36 
 
 
174 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  35.09 
 
 
178 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  32.54 
 
 
176 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.25 
 
 
193 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  32.54 
 
 
176 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  37.36 
 
 
174 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  35.2 
 
 
189 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  31.95 
 
 
176 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  31.95 
 
 
176 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  30.6 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.52 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  31.95 
 
 
176 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.07 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.68 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  31.98 
 
 
184 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.07 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.84 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.57 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  33.15 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  34.68 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  33.15 
 
 
186 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0580  cytochrome b561  38.82 
 
 
100 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.971319  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  32.42 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  32.04 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  30.81 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.37 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  33.72 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.91 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0380  cytochrome B561  29.84 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.63 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.25 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  27.68 
 
 
175 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  34.05 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  26.82 
 
 
175 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  31.76 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>