297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0380 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0380  cytochrome B561  100 
 
 		 189 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  75.13 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  35.6 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30.94 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  34.97 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  31.77 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  31.77 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.77 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.77 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  31.77 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  31.77 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  32.29 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  29.84 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.75 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32.97 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30.53 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.53 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  34.9 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  30.11 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.32 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  32.97 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  31.96 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  29.79 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  28.42 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.74 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.02 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  28.49 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30.6 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  31.89 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.39 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  34.33 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.39 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30.94 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  31.67 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  30.48 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  28.88 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.22 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  29.84 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  34.22 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.77 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  30.43 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.59 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  31.69 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.08 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  28.88 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  28.42 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  27.22 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  33.51 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  28.11 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  28.11 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  31.75 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  27.32 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  30.41 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.19 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.48 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  31.55 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  31.91 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  31.84 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  30.81 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  30.81 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  32.63 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  28.95 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.51 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  31.25 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  30.48 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  29.02 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  30.48 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  27.75 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  28.26 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  30.85 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  31.49 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  29.57 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  29.57 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  28.25 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  29.57 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  31.05 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  27.17 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  28.72 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  31.75 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  30.89 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  30.85 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  27.75 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  30.9 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  33.58 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  29.79 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  33.58 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  33.58 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  27.75 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  25.95 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  25.95 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  25.95 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  27.37 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  27.13 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  30.56 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  26.18 
 
 		 441 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  33.51 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>