More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0098 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  80.63 
 
 		 191 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  79.06 
 
 		 191 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  61.31 
 
 		 175 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  61.9 
 
 		 175 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  64.53 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  44.05 
 
 		 177 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  43.45 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  42.86 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  42.86 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  42.86 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  42.86 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  42.86 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  42.86 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  38.82 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.36 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.88 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.12 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  37.3 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.84 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.84 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.84 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  36.16 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.24 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.43 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.03 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.36 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.66 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  32.94 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.27 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.92 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.71 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.71 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.3 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  33.52 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  34.64 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  37.22 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  33.14 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.23 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  39.79 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.79 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.14 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.79 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  29.24 
 
 		 204 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  34.43 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.4 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  36.26 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  35.56 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  29.65 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  35.91 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.81 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.78 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  31.79 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  33.14 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.4 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  30.86 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.25 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  28.07 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  31.03 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  29.05 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.21 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  30.41 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  30.77 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  31.95 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  26.86 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  32.2 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  31.52 
 
 		 441 aa  74.7  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  30.06 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  31.49 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  34.91 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  31.11 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  30.99 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.8 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  31.52 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  29.07 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  28.8 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  29.31 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  31.61 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  30.11 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.74 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.74 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  26.63 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  34.43 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  29.94 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  31.1 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  35.47 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.65 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.43 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  33.71 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  34.83 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  31.79 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  33.52 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  35.71 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  34.48 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  30.91 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  27.98 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  33.52 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  28.07 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>