More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1903 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  100 
 
 		 177 aa  343  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  99.44 
 
 		 177 aa  342  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  98.87 
 
 		 177 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  98.87 
 
 		 177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  98.87 
 
 		 177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  98.87 
 
 		 177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  98.87 
 
 		 177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  93.22 
 
 		 177 aa  323  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  47.43 
 
 		 191 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  48.26 
 
 		 175 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  47.09 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  44.64 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  43.45 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  45.83 
 
 		 179 aa  131  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.26 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.14 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.44 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  32.74 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.51 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.33 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.79 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  40.57 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  31.79 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.9 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.79 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  31.89 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.89 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.92 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.21 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30.34 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  29.78 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.61 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30.86 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.12 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  36.09 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  32.42 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  32.79 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  31.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  31.18 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  30.81 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  34.94 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  34.12 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  29.41 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30.29 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  32.76 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  30.56 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  36.36 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.07 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  34.08 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  31.98 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  34.94 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  30.48 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  32.56 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.56 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.56 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  32.56 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  32.56 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  33.9 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  37.57 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.19 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  33.93 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.79 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.42 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  34.71 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  32.56 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.33 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  34.3 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  29.89 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.43 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  35.91 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  30.43 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  31.25 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  31.25 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  31.49 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  32.56 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.64 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  29.89 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.94 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  29.61 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  32.56 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  33.92 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  32.56 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  29.89 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.6 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  33.92 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  29.65 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  31.87 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  28.96 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  29.89 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29.55 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.75 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0357  cytochrome B561  29.95 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  34.59 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  29.38 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.6 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.12 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  30.11 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  28.96 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  31.07 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>