More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3615 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  94.94 
 
 		 178 aa  326  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  85.39 
 
 		 178 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  92.13 
 
 		 178 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  91.01 
 
 		 178 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  68.93 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  67.05 
 
 		 178 aa  247  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  67.05 
 
 		 178 aa  247  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  67.05 
 
 		 178 aa  247  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  67.05 
 
 		 178 aa  247  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  67.05 
 
 		 178 aa  247  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  66.48 
 
 		 225 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  60 
 
 		 190 aa  214  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  61.54 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  49.41 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  41.38 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  39.18 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  39.31 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  37.91 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  43.82 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  39.23 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  39.23 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  41.48 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  39.53 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  35.43 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  35.43 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  35.43 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  39.77 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  38.07 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  38.07 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  38.07 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.07 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.07 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  38.07 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.07 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  37.14 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.07 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  37.64 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.87 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.91 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.87 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.87 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  39.77 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.24 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  39.77 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  39.24 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  35.43 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  39.77 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  38.2 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  41.38 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  38.42 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  37.21 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  39.08 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  33.33 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  33.33 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  36.57 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.48 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  32.76 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  32.76 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  32.76 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  38.51 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  37.93 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  34.5 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  37.93 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  32.4 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.29 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.51 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  36.57 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.89 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.33 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.84 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.2 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.89 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.52 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  34.76 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  32.76 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  34.59 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  34.27 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  35.12 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  35.21 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.71 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  32.58 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.43 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.14 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  30.88 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.51 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  28.25 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.51 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.05 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  33.14 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  32.56 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>