More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0993 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  100 
 
 		 177 aa  357  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  74.58 
 
 		 177 aa  286  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  52.54 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  50.85 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  47.46 
 
 		 176 aa  173  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  46.89 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  46.89 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  46.89 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  46.89 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  46.89 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  49.15 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.83 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  44.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  44.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  44.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  48.02 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  46.59 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  44.83 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  46.59 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  46.59 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  48.02 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.83 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1755  cytochrome b561  48.02 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000553481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0972  cytochrome B561  44.38 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  39.43 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  47.74 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  47.09 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  46.51 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  46.45 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  47.09 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  45.98 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  39.08 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  46.45 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  46.45 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  41.42 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  39.18 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  45.81 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  38.86 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  39.2 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  38.07 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01374  cytochrome b561  47.46 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2228  cytochrome B561  47.46 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.013498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01386  hypothetical protein  47.46 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2023  cytochrome b561  47.46 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1642  cytochrome b561  47.46 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2241  cytochrome b561  47.46 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1500  cytochrome b561  47.46 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1598  cytochrome b561  47.46 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  40.12 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  42.05 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  33.52 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  34.27 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  36.72 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  40.35 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  36.84 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  35.5 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  35.47 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.47 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  35.47 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  35.47 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  35.47 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.47 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  35.47 
 
 		 225 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  38.64 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  34.46 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  38.95 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  38.07 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  36.72 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  34.68 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  37.14 
 
 		 178 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  37.14 
 
 		 178 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  37.14 
 
 		 178 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  36.67 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  33.33 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  30.99 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  33.33 
 
 		 174 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  31.76 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  33.91 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30.46 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  33.33 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  30.86 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  31.46 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0580  cytochrome b561  45.35 
 
 		 100 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.971319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  30.64 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.4 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  29.44 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  35.47 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.71 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.2 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  30.86 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  34.29 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.68 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  28.9 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.82 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  29.55 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.65 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  28.49 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  33.91 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>