288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2432 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0380  cytochrome B561  75.13 
 
 		 189 aa  278  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.2 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  30.6 
 
 		 229 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  30.05 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  30.05 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  30.05 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.05 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.05 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  30.05 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.22 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  30.21 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  31.86 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.89 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  29.9 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  32.78 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.81 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.77 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  29.57 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  30.21 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.89 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30.98 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  29.67 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.43 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  29.67 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  31.11 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  29.67 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.27 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.9 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.47 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30.22 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  33.58 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  29.12 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  29.41 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  29.51 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  28.96 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.47 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  28.96 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  31.94 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  30.69 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  30.05 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  29.51 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.24 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  28.11 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  27.87 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  31.52 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  28.19 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  29.73 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  27.87 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29.1 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  30.22 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  29.85 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  29.12 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  30.77 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  27.91 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  31.35 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  27.42 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  27.75 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  28.34 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  27.75 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  28.42 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  30.21 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  28.42 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  30.85 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  28.11 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  31.34 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  31.34 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  31.34 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  28.42 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  27.75 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  28.11 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  28.11 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  27.23 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  28.11 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.11 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  30.43 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  28.11 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.65 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  30.32 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.65 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  28.11 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  29.65 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  25.68 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  31.28 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  26.9 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  30.88 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  30.88 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  30.88 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  26.49 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  26.49 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  27.23 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  31.28 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  30.6 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  26.49 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.32 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  30.6 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  30.23 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  30.96 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  28.96 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>