294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0490 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  100 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  50 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  51.79 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  48.57 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  50.3 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0164  cytochrome B561  54.6 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0793  cytochrome B561  51.53 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0252714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  44.05 
 
 		 208 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  38.1 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  37.36 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.73 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  37.28 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  38.01 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  36 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  33.33 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  34.09 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  37.14 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.65 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  34.91 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.78 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  35.29 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.09 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  33.52 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  32.45 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  31.95 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  34.91 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  34.97 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  34.27 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  34.27 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.1 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  34.27 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.54 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.57 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  37.57 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  37.57 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  37.57 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  37.57 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  35.5 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  37.57 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  37.57 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.95 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  34.27 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.82 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  32.2 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  32.2 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  37.28 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  32.2 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.51 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.51 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.51 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  30.86 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  34.27 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  32.62 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30.51 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  31.74 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  35.93 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.96 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  32.43 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.51 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.96 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.98 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  32.97 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.96 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.53 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.99 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.61 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.96 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.21 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30.99 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  32.35 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  33.33 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.29 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32.2 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  30.11 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  30.11 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.37 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.37 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  32.09 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  30.11 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  34.46 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  33.15 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.76 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.38 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  29.57 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.79 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1874  cytochrome B561  37.95 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.75 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  34.29 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  33.71 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  33.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  29.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>