104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0357 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0357  cytochrome B561  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0820  putative cytochrome B561  81.07 
 
 		 169 aa  285  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2478  cytochrome B561  80.47 
 
 		 169 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.167095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2376  cytochrome B561  34.78 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3663  cytochrome B561  32.14 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2939  cytochrome B561  26.54 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0963737  normal  0.875697 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.95 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  29.95 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  29.44 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1574  cytochrome b562  34.57 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3963  cytochrome B561  31.55 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0226  cytochrome B561  34.57 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.81 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  27.81 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  29.12 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  28.72 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  29.95 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  27.37 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  29.05 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  27.93 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  27.72 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  28.09 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  23.89 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  27.87 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  29.95 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  27.57 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  26.09 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  27.57 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  27.81 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  27.13 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  27.32 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  24.72 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  27.17 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  28.49 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  26.63 
 
 		 186 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  25.41 
 
 		 229 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.49 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  25.68 
 
 		 180 aa  50.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  27.37 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  29.51 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  27.51 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  25.54 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  24.73 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.12 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  24.86 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  24.86 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.86 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.86 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  24.86 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5858  cytochrome B561  30.82 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  24.31 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  27.47 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.62 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  28.49 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  25.28 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  25.28 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  25.28 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  26.74 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  28.12 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  25.93 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  24.86 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  26.26 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  31.36 
 
 		 420 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  27.53 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  24.04 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  27.42 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  26.86 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  26.37 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  24.21 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  32.41 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  24.18 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  32.41 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  23.5 
 
 		 222 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  27.87 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  25.15 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  27.87 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  23.76 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  28.33 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  23 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  28.46 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  27.03 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  23.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  23.5 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  26.23 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  28.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  26.63 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  24.18 
 
 		 400 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  28.49 
 
 		 182 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3680  cytochrome B561  27.73 
 
 		 177 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  26.26 
 
 		 177 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  26.63 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  50 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  26.23 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>