72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3680 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3680  cytochrome B561  100 
 
 		 177 aa  345  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  24.86 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  24.87 
 
 		 410 aa  54.3  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  32.09 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  31.52 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  29.9 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  24.79 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  30.3 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  28.09 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  29.24 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  26.7 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  26.7 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  26.86 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  26.86 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  24.79 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  30.23 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  28.96 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  27.52 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.33 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  27.89 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  26.16 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  28.18 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.43 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.15 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  28.32 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.15 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.56 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  32.39 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  26.26 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  26.09 
 
 		 400 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  29.13 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  28.32 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  26.83 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  26.28 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  26.16 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  25.68 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  26.29 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  26.29 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  25.58 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30.34 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  28.8 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  30 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  27.36 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0357  cytochrome B561  24.42 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  27.57 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  26.45 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  27.27 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.52 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  25.14 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  31.3 
 
 		 397 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  28.19 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  24.28 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  26.97 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  28.19 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  25.15 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  28.19 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  26.04 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  27.19 
 
 		 197 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.24 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  26.46 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  26.67 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  30.77 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  27.37 
 
 		 406 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  25.73 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  25.81 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  28.88 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  26.92 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  24.79 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  26.63 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  26.92 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>