184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3663 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3663  cytochrome B561  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3963  cytochrome B561  88.55 
 
 		 166 aa  293  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0820  putative cytochrome B561  34.13 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2478  cytochrome B561  33.53 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.167095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2376  cytochrome B561  36.59 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0357  cytochrome B561  32.14 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  32.97 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2939  cytochrome B561  32.52 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0963737  normal  0.875697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  31.25 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.46 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.98 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  35.37 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  34.93 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  33.15 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  33.15 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.15 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.15 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  33.15 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  30.85 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  32.58 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.46 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.58 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.6 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  28.73 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.17 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  31.64 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  27.98 
 
 		 199 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  31.94 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  27.98 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.34 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  31.35 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.4 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.4 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.58 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  29.32 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.27 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.91 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.67 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  32.57 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  30.17 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  30.23 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  30.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18060  hypothetical protein  33.71 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.645092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  30.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  33.71 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  26.97 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  29.61 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  29.71 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  29.05 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  29.05 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  30.06 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  31.94 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  30.07 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  24.72 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  30 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  24.72 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  24.72 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  25.67 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  29.2 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  28.87 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  28.18 
 
 		 176 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  26.7 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  30.77 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  30.77 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.77 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.77 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  30.36 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  30.71 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  31.28 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.03 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  30.39 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  29.44 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  29.79 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.77 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  28.18 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  28.67 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  29.79 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  26.67 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  28.89 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  27.27 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  29.38 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  29.08 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  28.65 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  31.32 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  26.11 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.38 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.38 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  26.67 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  26.4 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  28.65 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  29.11 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  29.08 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  29.08 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  33.93 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.22 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  32.73 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  32.73 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>