292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3871 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  42.35 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26070  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.702919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2226  hypothetical protein  46.35 
 
 		 193 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  35.35 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  35.35 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.32 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  34.63 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  29.23 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  29.59 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  28.22 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  27.89 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  31.84 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  32.35 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  26.21 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  31 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  28.29 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.16 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.29 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.42 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  30 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  28.14 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  30.05 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.65 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  30.53 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.09 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.35 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  31.47 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.53 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  29.63 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  31.28 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.35 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  32.21 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  31.63 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  29.61 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  31.5 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  27.27 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30.96 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.46 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  31.49 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.7 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  31.28 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  29.76 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  32.49 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  30.62 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  31.94 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  31.16 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.9 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.38 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30.3 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30.3 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30.3 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  31.96 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  31.96 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.03 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.64 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  29.89 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  30.26 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  33.84 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  29.23 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  29.23 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  29.59 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  30.15 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.3 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  27.51 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  30.39 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  28.22 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  30.2 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.73 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  32.49 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  30.77 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.12 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  30.05 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.72 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  30 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  28.06 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  30.46 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  29.53 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.53 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  27.64 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  32.81 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  30.54 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  30.61 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  29.9 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  30.1 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  27.81 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  29.57 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.02 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  31.47 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  27.09 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  30.93 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>