270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0072 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  100 
 
 		 196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  42.35 
 
 		 195 aa  167  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26070  hypothetical protein  45.05 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.702919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2226  hypothetical protein  42.86 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  28.57 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.32 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  32.18 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3071  hypothetical protein  28.22 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.751989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2077  hypothetical protein  27.22 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  32.82 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  30.81 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.71 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  26.42 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  32.84 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  30.54 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.44 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  32.34 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  30.96 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  29.65 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  28.79 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  28.22 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  28.28 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.41 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  28.92 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  28.92 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  28.86 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  31.77 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  28 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  28.92 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  28.28 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.28 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  28.79 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  30 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29.35 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  27.78 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  27.84 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  28.79 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  27.78 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  27.84 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  27.78 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  29.15 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  29.15 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.21 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  27.44 
 
 		 410 aa  68.2  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  27.23 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  25.89 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  28.57 
 
 		 406 aa  67.8  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  29.7 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  29.7 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  29.29 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  26.74 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  28.8 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  27.27 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30.73 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  27.27 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  28.86 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  28.14 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  28.87 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  29 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  28.86 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  29.84 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  24.87 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  28.43 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  28.36 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  34.35 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  28.36 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  29.79 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  29.44 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  29.79 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  28.5 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  28.35 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  26.87 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  27.45 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.14 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  26.02 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  27.84 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  28.14 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  29.59 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  25.39 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  24.35 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  26.53 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  28.87 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  27.08 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  25.13 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  24.62 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  27.32 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  25.77 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  25.65 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  25.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  25.65 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>