240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_26070  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.702919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2226  hypothetical protein  95.83 
 
 		 193 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  50 
 
 		 195 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  45.05 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.13 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  30.65 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.32 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  28.33 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.55 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  25.51 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  33 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  25.51 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.5 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  30.81 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  32.64 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.39 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  32.65 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.57 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  32.65 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  27.55 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  29.65 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  29.84 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.8 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  31.63 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  32.31 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.5 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  26.13 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  28.88 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.23 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  32.12 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.69 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  32.12 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  39.84 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  31.5 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  30.96 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  32.49 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  29.15 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  25.41 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  32.98 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  31.61 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  31.61 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  30.77 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  30.05 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  29.41 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  29.23 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  28.12 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.26 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  30.05 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  30.05 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  29.32 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  26.74 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0144  cytochrome B561  32.24 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.876682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  30.97 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  29.57 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.41 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.02 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  27.36 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  28.72 
 
 		 420 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  28.19 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  28.65 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  28.65 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  28.65 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  32.99 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.45 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  28.11 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  28.57 
 
 		 406 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  26.94 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  30.77 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.91 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  31.25 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  28.49 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  28.04 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  26.74 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  24.86 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  30.85 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  32.4 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  28.28 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  27.09 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  30 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  27.13 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  29.22 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.34 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.28 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  30.46 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.26 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  31.71 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  29.44 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  31.84 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>