More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0144 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0144  cytochrome B561  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.876682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1066  cytochrome B561  48.62 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.54 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.69 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  39.44 
 
 		 420 aa  101  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  39.78 
 
 		 176 aa  98.6  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  38.1 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.57 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  33.86 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  38.8 
 
 		 179 aa  89.4  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  35.48 
 
 		 406 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  35.53 
 
 		 410 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.39 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  36.91 
 
 		 416 aa  88.2  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  35.33 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  31.87 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  35.39 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.86 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  34.59 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.79 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.43 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  31.52 
 
 		 183 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.14 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  30.11 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  31.52 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  34.72 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.57 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.28 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.27 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  31.52 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.28 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.29 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  32.76 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.44 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.44 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.39 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5252  cytochrome B561  39.87 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  34.39 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.77 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  31.75 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  34.64 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.18 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  37.44 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.98 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.58 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  31.89 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  31.58 
 
 		 397 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  29.57 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  29.57 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  35.23 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  29.57 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  29.57 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.57 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.57 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.57 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.42 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  30.22 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.02 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.57 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.02 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.2 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  32.75 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  29.67 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  32.26 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  32.07 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  30.81 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.7 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.43 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  32.26 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  30.89 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  32.62 
 
 		 400 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3000  cytochrome B561  30.22 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426718  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  32.2 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  32.45 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.64 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  32.78 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  31.12 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.68 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  31.82 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  29.67 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.24 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  32.24 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.43 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29.95 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  28.73 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.11 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.77 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30.68 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  34.86 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.47 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  27.84 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  33.33 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  28.9 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.5 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.64 
 
 		 441 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.83 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>