More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2731 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  376  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  61.67 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6716  cytochrome B561  57.06 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.405595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6481  cytochrome B561  57.06 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156501  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  42.86 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  40.11 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  35.56 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  40.98 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  40 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  37.08 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  39.38 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.72 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  37.29 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.96 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  39.38 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.72 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.16 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  37.57 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  36.52 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  37.57 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.68 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  36.52 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  32.43 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  36.52 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  36.72 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  34.86 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.83 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  34.57 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.71 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  33.95 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  38.24 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.71 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  33.92 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  37.71 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  36.26 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.91 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  37.5 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  34.29 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.43 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  35.47 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  34.71 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  36.31 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  31.48 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  31.48 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.31 
 
 		 176 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  31.48 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  31.48 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  32.81 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.1 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.1 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  36.46 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  30.86 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.81 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  30.46 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.1 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.16 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  31.48 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  32.16 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  35.11 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  34.44 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  29.82 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  33.86 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.71 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  35.96 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  31.67 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.5 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  32 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.52 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  33.51 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  35.43 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  29.38 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1066  cytochrome B561  39.66 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  37.02 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.86 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.8 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  35.42 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  30.17 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.87 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.52 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  29.55 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  29.44 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.08 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  35.22 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  29.28 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  28.57 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  35.26 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  33.33 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  31.18 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  30.6 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  30.6 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  29.48 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  30.6 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.6 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.6 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.6 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>