More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0302 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  100 
 
 
181 aa  357  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  61.24 
 
 
185 aa  214  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  53.93 
 
 
182 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  52.3 
 
 
178 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  40.34 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  37.95 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  38.46 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.22 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  37.99 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  37.5 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  37.5 
 
 
176 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  38.69 
 
 
187 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.79 
 
 
175 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  37.93 
 
 
174 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.93 
 
 
175 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  36.87 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.43 
 
 
178 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.52 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  36.21 
 
 
190 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.36 
 
 
186 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  36.93 
 
 
176 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  36.93 
 
 
176 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.36 
 
 
186 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  36.93 
 
 
179 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.63 
 
 
186 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  39.23 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  37.14 
 
 
175 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  36.42 
 
 
178 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  39.77 
 
 
185 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.61 
 
 
173 aa  101  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  42.86 
 
 
193 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  35.09 
 
 
204 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.43 
 
 
182 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  35.26 
 
 
181 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.63 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.86 
 
 
186 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  38.6 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  40.34 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  38.6 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.67 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  37.36 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  39.2 
 
 
181 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.71 
 
 
186 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.5 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.92 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  41.52 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  37.43 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.09 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.76 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  38.37 
 
 
210 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  37.29 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  37.29 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.23 
 
 
197 aa  95.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  36.42 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.72 
 
 
195 aa  94.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  39.33 
 
 
197 aa  94.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32.39 
 
 
184 aa  94  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  37.16 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.1 
 
 
193 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  29.12 
 
 
193 aa  92  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  29.41 
 
 
181 aa  90.9  8e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  30.81 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.56 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.1 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  39.57 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  36.63 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.48 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  29.48 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  34.46 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  37.87 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  34.83 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  37.43 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.64 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  33.74 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.24 
 
 
190 aa  87.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  30.56 
 
 
183 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.96 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  32.18 
 
 
183 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30.56 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.56 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  37.85 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  32.18 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  31.61 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.96 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  34.48 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  32.18 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  31.77 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  32.98 
 
 
192 aa  85.1  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  34.29 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  39.88 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  32.18 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32.76 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  32.18 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  35.03 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  37.85 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  38.98 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  37.28 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  32.76 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>