More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0231 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  360  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  96.81 
 
 		 188 aa  305  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  60.99 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  83.24 
 
 		 200 aa  208  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  77.46 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  57.95 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  57.95 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  57.39 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  57.95 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  56.82 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  60.47 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  56.82 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  56.82 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  60 
 
 		 179 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  57.23 
 
 		 175 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  56.07 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  56.07 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  61.49 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  55.49 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  58.96 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  57.49 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  57.49 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  60.59 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  56.89 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  56.29 
 
 		 177 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  52.66 
 
 		 180 aa  130  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  53.18 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  56.89 
 
 		 177 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  52 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  51.16 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  55.09 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  50.58 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.86 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.52 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.73 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  38.37 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.98 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  39.53 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  38.29 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  38.37 
 
 		 178 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.79 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.79 
 
 		 222 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  36.16 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.09 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.57 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.09 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.09 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.09 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.89 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  38.15 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  35.09 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.87 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.2 
 
 		 203 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.71 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.09 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  33.71 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.26 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  33.91 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  34.97 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.97 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  42.2 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  36.78 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  31.79 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  38.98 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.14 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.27 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  33.71 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  36.36 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.79 
 
 		 173 aa  85.1  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  37.63 
 
 		 190 aa  84.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  30.98 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.02 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  38.41 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  35.17 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  35.5 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.91 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  37.5 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.18 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  34.52 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.02 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  33.92 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.3 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  34.29 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.53 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.12 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.63 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.71 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.91 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.63 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  30.9 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  39.16 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  33.33 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  34.91 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  35.58 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.8 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  32.95 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  33.13 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29.35 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.25 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>