283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0932 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  41.04 
 
 
173 aa  129  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  36.26 
 
 
181 aa  110  9e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  30.77 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  34.48 
 
 
193 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  38.01 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  29.82 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.95 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.95 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.14 
 
 
179 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  29.71 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.18 
 
 
186 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  33.92 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  28.65 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  32.77 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  30.64 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  28.82 
 
 
188 aa  88.2  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  32.52 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.37 
 
 
197 aa  87.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.74 
 
 
195 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  28.99 
 
 
182 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.43 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  34.71 
 
 
188 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  30.81 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  33.53 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.52 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.41 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  32.78 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  28.09 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.03 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.03 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30.41 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  28.74 
 
 
193 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  31.21 
 
 
186 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  31.52 
 
 
222 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.31 
 
 
186 aa  84  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  30.49 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  29.71 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.01 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30.34 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.6 
 
 
192 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  33.33 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30.34 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.64 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  33.89 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.9 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  30.29 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  28.31 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  30.81 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  32.78 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  26.86 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  29.48 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  32.39 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  32.76 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  29.78 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  29.78 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  31.43 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  31.43 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  29.78 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  29.65 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.78 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.78 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.57 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  30.99 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.78 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  29.78 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.78 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  28.9 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  30.9 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  32.58 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  27.93 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  31.46 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  30.9 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  30.9 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  33.15 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  26.29 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  29.31 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  30.11 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  27.06 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  28 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  28.82 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  31.58 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  33.33 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  29.14 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  31.18 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  30.18 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  30.29 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  30.56 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  27.17 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  28.92 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  30.59 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  27.01 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  31.58 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  29.48 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  32.16 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  26.95 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  28.57 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  31.95 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6481  cytochrome B561  32.96 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>