More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1186 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  43.93 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.84 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  37.29 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  34.46 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  41.81 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.86 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  36.47 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  37.21 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  37.14 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  38.29 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  33.14 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.36 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  34.09 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.08 
 
 		 181 aa  94.4  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  33.88 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  33.54 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  34.97 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  33.92 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  34.46 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.31 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.95 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  33.89 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.16 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.16 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  33.16 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.16 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.16 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.16 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.16 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  39.01 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.71 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.52 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.29 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  29.44 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  35.26 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  35.91 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  38.6 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  33.71 
 
 		 183 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  32.96 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.25 
 
 		 173 aa  85.1  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.29 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.33 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  31.43 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  31.43 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.52 
 
 		 213 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  30.54 
 
 		 178 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  32.2 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  35.91 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  31.43 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  30.86 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  30.86 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.8 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  37.57 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.42 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  30.86 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.28 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.73 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.03 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  28.73 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  28.73 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.73 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.73 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  28.73 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0972  cytochrome B561  37.43 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  27.98 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  33.33 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  34.88 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  32.97 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  29.83 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  32.18 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  31.84 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  28.73 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  34.46 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  32.89 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  34.46 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  31.07 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  34.46 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  33.12 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.77 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  33.12 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  33.12 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.33 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.48 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  30.11 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  30.39 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  31.11 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  30.39 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  32.56 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  29.03 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  30.27 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  30.54 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.66 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  28.42 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  30.11 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  29.03 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  34.27 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>