113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1732 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1732  cytochrome B561  100 
 
 
382 aa  751    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0790  hypothetical protein  41.71 
 
 
205 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278967 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1612  hypothetical protein  36.65 
 
 
198 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4278  hypothetical protein  36.93 
 
 
205 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  31.17 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  32.74 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  32.74 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  29.37 
 
 
188 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1723  hypothetical protein  29.89 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2730  hypothetical protein  30.43 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1911  hypothetical protein  26.6 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.330225  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2245  copper uptake transmembrane transporter  28.42 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2183  hypothetical protein  28.42 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.58 
 
 
195 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  28.1 
 
 
193 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1747  hypothetical protein  25.27 
 
 
197 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  28.24 
 
 
186 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  29.01 
 
 
206 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  27.74 
 
 
186 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  32.89 
 
 
188 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  28.06 
 
 
181 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  27.34 
 
 
193 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.69 
 
 
182 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  27.48 
 
 
186 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  26.67 
 
 
186 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0356  hypothetical protein  26.4 
 
 
189 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  27.1 
 
 
186 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  27.1 
 
 
186 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  30.19 
 
 
197 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  27.1 
 
 
186 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0349  hypothetical protein  26.19 
 
 
186 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  26.67 
 
 
186 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  26.11 
 
 
191 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  30.77 
 
 
177 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  24.71 
 
 
187 aa  56.6  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  27.75 
 
 
185 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  26.42 
 
 
184 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  28.68 
 
 
191 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  25.6 
 
 
189 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13161  hypothetical protein  26.9 
 
 
187 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.103752  normal  0.243929 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  26.24 
 
 
189 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  24.17 
 
 
183 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  26.43 
 
 
181 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  26.14 
 
 
183 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  31.69 
 
 
190 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  28.17 
 
 
183 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19361  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.703237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  25.37 
 
 
182 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  26.62 
 
 
181 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.2 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  26.72 
 
 
186 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.2 
 
 
182 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  21.66 
 
 
173 aa  50.4  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  23.95 
 
 
184 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  26.15 
 
 
181 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  27.27 
 
 
192 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14331  hypothetical protein  26.79 
 
 
177 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  29.23 
 
 
178 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  26.15 
 
 
181 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  28.46 
 
 
182 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  27.48 
 
 
187 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  28.46 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  28.46 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  26.22 
 
 
186 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  28.46 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  28.46 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  28.46 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.46 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  28.46 
 
 
187 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  26.32 
 
 
176 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  27.03 
 
 
188 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  24.24 
 
 
189 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0838  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.653362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  30.83 
 
 
182 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  25.37 
 
 
183 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16911  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  28.29 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  28.87 
 
 
187 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.5 
 
 
204 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  26.04 
 
 
181 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  26.58 
 
 
173 aa  47.4  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  24.26 
 
 
180 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  26.06 
 
 
182 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  27.4 
 
 
179 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  27.83 
 
 
183 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  28.03 
 
 
183 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  22.41 
 
 
183 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  33.33 
 
 
203 aa  46.2  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  24.54 
 
 
197 aa  46.2  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  27.39 
 
 
183 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  26.38 
 
 
186 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  22.99 
 
 
183 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0898  hypothetical protein  26.47 
 
 
186 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.919222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  26.47 
 
 
183 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14571  hypothetical protein  27.98 
 
 
177 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  27.48 
 
 
181 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  27.46 
 
 
188 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  24.14 
 
 
196 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  24.31 
 
 
183 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  25.87 
 
 
180 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>