More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4644 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  344  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  56.74 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  60.8 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  55.62 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  54.65 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  52.27 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  54.65 
 
 		 174 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  54.65 
 
 		 175 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  51.7 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  52.87 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  54.71 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  52.3 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  52.3 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  52.3 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  53.45 
 
 		 176 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  56.29 
 
 		 190 aa  168  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  59.06 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  56.4 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  56.4 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  53.93 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  52.05 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  51.46 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  56.18 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  54.86 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  53.37 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  50.57 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  50.88 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  51.69 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  53.76 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  53.18 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  59.66 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  36.11 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  37.21 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  48.86 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  35.06 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.7 
 
 		 185 aa  97.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  35.43 
 
 		 191 aa  97.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.44 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.52 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.52 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  38.07 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  36.57 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  35.23 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.76 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.89 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.85 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  36.69 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.76 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.02 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.76 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.1 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  37.99 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  37.5 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  35.5 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.89 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.95 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  32.95 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  37.43 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  36.11 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.81 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  37.36 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  36.63 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.91 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.72 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32.37 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  32.97 
 
 		 189 aa  84  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.56 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  35.8 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.91 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.52 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  37.5 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.39 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.93 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  37.5 
 
 		 416 aa  81.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.97 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.97 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.54 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.91 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.56 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.56 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  36.2 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  32.6 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  27.91 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.84 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  33.14 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  29.38 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  35.63 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.03 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  29.7 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  36.42 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  35.71 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  36.21 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  32.18 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.26 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  35 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  36.59 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.66 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6716  cytochrome B561  34.08 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.405595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>