273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6716 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6716  cytochrome B561  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.405595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6481  cytochrome B561  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  64.04 
 
 		 187 aa  214  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  58.76 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  38.2 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  34.46 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.43 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  35.45 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.87 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.87 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.87 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  33.16 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  35 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.56 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.16 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.16 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.39 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  35.03 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.89 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.39 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.67 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.94 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.98 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  34.36 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  29.78 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.91 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  32.93 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.94 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  35.2 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.15 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  36.87 
 
 		 421 aa  81.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.61 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.45 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  33.52 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.16 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.68 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.52 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  35.91 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.64 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.66 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  31.4 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.92 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  35.39 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  30.34 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.76 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.76 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.76 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.77 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.8 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  32.76 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.12 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  32.4 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.05 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.05 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.05 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.05 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  34.05 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.45 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  32.42 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  34.91 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.07 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  31.28 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  29.94 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.51 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.51 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.71 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.51 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  34.32 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  37.16 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.3 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.15 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.78 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  28.8 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.07 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  29.67 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.3 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.24 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  31.18 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  29.67 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  32.6 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  29.67 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  32.6 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  31.15 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.58 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.15 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.51 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34.27 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.41 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  29.26 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  29.12 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  34.12 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  32.6 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  29.41 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.98 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.23 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  33.33 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  29.65 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>