249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3894 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  50.3 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  52.35 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  50 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  50.6 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0164  cytochrome B561  53.49 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0793  cytochrome B561  49.11 
 
 		 190 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0252714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  37.5 
 
 		 208 aa  91.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  35.67 
 
 		 188 aa  91.3  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  34.48 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.14 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  34.46 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  31.82 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  31.76 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  38.29 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  30.41 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  30.17 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  38.29 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.71 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  28.98 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  27.06 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  28.9 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  27.98 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.32 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.58 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  31.76 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  31.21 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  29.65 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  31.61 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  31.67 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  34.12 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30.77 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30.77 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  32 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.43 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  30.77 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  32.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30.18 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.12 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  34.12 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  25.95 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  24.71 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.12 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.76 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.18 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  31.4 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  32.39 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  33.91 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  33.91 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.12 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  32.16 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1874  cytochrome B561  36.14 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  33.91 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  33.91 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  31.28 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  30.73 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  28.99 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  30.41 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.4 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.76 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  27.43 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  30.77 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.34 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  30.17 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  31.21 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  30.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  31.79 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  29.78 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.28 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  29.38 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  30.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  30.73 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  31.43 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  27.75 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  29.44 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  31.4 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  28.02 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  29.65 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  31.89 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  32.95 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  31.18 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  29.12 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  30.77 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.18 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  33.14 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  32.37 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  31.28 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  25.29 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  29.14 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  31.95 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  29.12 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  27.81 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  31.61 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3034  cytochrome B561  31.29 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  32.37 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  30.68 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  32.37 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>