273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0164 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0164  cytochrome B561  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  53.49 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  54.6 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  52.63 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  53.85 
 
 		 174 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0793  cytochrome B561  56.67 
 
 		 190 aa  150  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0252714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  52.94 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  40.94 
 
 		 208 aa  97.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  37.08 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  34.27 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  38.46 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  39.66 
 
 		 191 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  35.03 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  38.33 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  33.81 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.68 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  37.5 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.95 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.1 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  38.6 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  38.6 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  35.6 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  33.13 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.6 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  38.51 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  38.51 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  38.51 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  38.51 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.91 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  37.43 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.09 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.86 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.86 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.88 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.05 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.07 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.91 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  34.05 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.82 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.29 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  37.99 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  37.99 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  32.96 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.71 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  34.08 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  36.96 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.17 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  26.16 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.79 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.79 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.86 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  38.12 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  32.8 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32.02 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.98 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  33.58 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32.57 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.09 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  35.59 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  35.08 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.78 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.36 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.51 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  30.37 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  28.9 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.77 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.64 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  29.59 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  32.18 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4238  cytochrome B561  30.17 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.295562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  28.89 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  33.52 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  32.18 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.18 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  33.14 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  30.73 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  28.09 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  32.75 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  29.38 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.15 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.79 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.61 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  30.64 
 
 		 420 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.03 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  31.51 
 
 		 416 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  31.61 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  32.16 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  31.61 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.81 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.36 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.61 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.61 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.81 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  35 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>